Rico Rodrigez újra visszatért, hogy szembeszálljon a Medici szigetén diktátorként uralkodó Di Rebellóval, aki zsarnoki módon sanyargatja a régió lakosságát, és a világuralomra pályázik – ha csak mi meg nem akadályozzuk ebben. Főhősünk oldalán egy több mint 1000 négyzetkilométeres, tehát óriási, szabadon bejárható szigetvilág vár ránk ahhoz, hogy megleckéztessük az önjelölt kiskirályt, és visszaállítsuk a régi rendet.
A Just Cause 3-ban ezúttal is igazán őrült, a legvadabb akciófilmeket is megszégyenítő pillanatok várnak ránk Rico irányításával, aki óriási fegyverarzenálja mellett a teljes szabadságot is kihasználhatja Rebello magánserege ellen, de a korábbi részekből megismert sajátos felszereléseiről sem kell majd lemondanunk.
Visszatér például a wing suit és az ejtőernyő, amelyek még a legveszélyesebb helyzetből is képesek lesznek kirántani minket, de csáklyánk is megújult formában áll a rendelkezésünkre, ezáltal segítségével bármihez odaránthatjuk magunkat, sőt mi több, akár már járműveket is összeláncolhatunk vele, hogy így okozzunk minél nagyobb pusztítást az ellenség soraiban.